Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms