Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGXB4Q9UGU5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms