Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms