Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD2Q9UBB5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms