Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP35Q9P2H5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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