Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms