Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJB4Q9NTQ9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms