Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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