Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SDHAF3Q9NRP4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms