Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP26Q9NRE1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms