Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPAG4Q9NPE6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms