Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE7BQ9NP56 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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