Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCAS3Q9H6U6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms