Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM5Q9C035 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM5Q9C035 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms