Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRNKL1Q9BZJ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRNKL1Q9BZJ0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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