Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms