Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms