Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms