Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms