Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms