Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIRIP3Q9BW71 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms