Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms