Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms