Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms