Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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