Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms