Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIK3R4Q99570 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms