Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms