Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms