Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKNOX2Q96KN3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms