Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM12Q96EX1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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