Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms