Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms