Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms