Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC1Q96C34 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms