Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APH1AQ96BI3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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