Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3C6Q969F1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms