Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR2Q969E8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms