Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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PTPRUQ92729 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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PTPRUQ92729 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
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