Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG3Q8WXD2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms