Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms