Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NGDNQ8NEJ9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NGDNQ8NEJ9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms