Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms