Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms