Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
VPS8Q8N3P4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS8Q8N3P4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms