Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms