Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL3Q8IVW4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL3Q8IVW4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL3Q8IVW4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL3Q8IVW4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL3Q8IVW4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL3Q8IVW4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKL3Q8IVW4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKL3Q8IVW4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms