Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX29P2Q8IUI4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms