Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms