Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA8AQ86V59 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PNMA8AQ86V59 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA8AQ86V59 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA8AQ86V59 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA8AQ86V59 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8AQ86V59 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8AQ86V59 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8AQ86V59 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA8AQ86V59 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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